Het NJA verzamelt en beheert een historische jazz-collectie waarbij het zwaartepunt ligt op het gebied van de Nederlandse jazz en de jazz in Nederland. Het archief bevat diverse soorten geluidsdragers, waaronder 78 toerenplaten, geluidsbanden en cd’s.
Daarnaast bestaat de collectie uit foto’s, boeken en tijdschriften (uit binnen- en buitenland), bladmuziek en arrangementen, een knipselarchief en curiosa zoals plakboeken.
Het NJA bezit ook unieke collecties zoals de collectie Michiel de Ruyter en de Waiszvis collectie. In de studio van het NJA worden radioprogramma’s opgenomen voor de Concertzender.

Het NJA is op afspraak toegankelijk voor belangstellenden, elke werkdag tussen 13:00 uur en 17:00 uur. Het grootste deel van de collectie is vrij in te zien en te bekijken. Er is een werktafel aanwezig en apparatuur om muziek te beluisteren en video’s te bekijken.